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    东辉印度洋舰队司令部下辖：

    第三舰队司令部，负责印度洋全域和南部非洲，总部计划设在马达加斯加；

    东辉大西洋舰队司令部下辖：

    第四舰队司令部，负责大西洋全域和东部非洲，总部计划设在几内亚。

    东辉海军南方司令部下辖：

    第五舰队司令部，负责整个南太平洋和中南美洲，总部计划设在巴拿马。

    东辉海军地中海舰队下辖：

    第六舰队司令部，负责整个欧洲和北部非洲，总部计划设在意大利加埃塔。

    东辉海军中央司令部下辖：

    第七舰队司令部，负责波斯湾、红海、阿拉伯海，以及肯尼亚以北的非洲东海岸，总部计划设在巴林的麦那麦。

    第八舰队司令部，负责东辉全境海岸警备，也称东辉海岸警卫队司令部，总部计划设在澳洲的悉尼。

    东辉海军特种作战司令部下辖：

    第九舰队司令部，负责执行全球特种作战和两栖攻击任务，总部计划设在印尼的苏门答腊。

    东辉海军电子战司令部和补给司令部，总部设在天堂岛。

    此外，程功还专门设置了一个东辉海军司令部，所有九支舰队的职能司令部（水面、航空兵、潜艇)均在海军司令部内实施合并，但实际运作方面可以保持独立指挥。

    增大了地勤人员编制，并设立了内河流域巡逻部队，组建海军远征作战司令部，把海军建制内所有地面力量集中在一个完整的指挥体系下。

    海军远征作战司令部包括海军工兵、军械爆破·处理、海军宪兵、打捞单位和内河巡逻队。

    计划组建十一个航母打击（战斗)群，一个远征打击两栖攻击群。

    远征打击两栖攻击群在两栖攻击舰编队内增加攻击型核潜艇和国王级战列舰，提高对地攻击火力和反潜能力。

    新建九艘弹道导弹核潜艇（ssbn）和九艘巡航导弹核潜艇（ssgn）。

    ssgn一次可携带154枚巡航导弹或50名特种作战人员，以提高对地攻击及濒海作战能力。
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